L’electroforesi és una tècnica de laboratori molt comú utilitzada per identificar, quantificar i purificar fragments d’àcids nucleics. Les mostres són carregades als pouets de gel d’agafades o acrilamida i sotmeses a un camp elèctric, de manera que els àcids nucleics carregats negativament es mouran cap a l’elèctrode positiu. Els fragments d’AN més curts viatjaran a través del gel més ràpidament, mentre que els fragments més grans ho faran més lentament, resultant en una separació basada en la mida.